Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEO1Q92859 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEO1Q92859 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms