Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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