Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113Q902F9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms