Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CTTNBP2Q8WZ74 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTTNBP2Q8WZ74 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms