Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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COPS9Q8WXC6 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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COPS9Q8WXC6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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COPS9Q8WXC6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
COPS9Q8WXC6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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