Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM46DQ8NEK8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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