Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms