Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L2Q8NAA4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms