Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms