Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBP4Q8N2S1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms