Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMNTD2Q8IXW0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms