Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms