Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms