Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD163Q86VB7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD163Q86VB7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD163Q86VB7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD163Q86VB7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD163Q86VB7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD163Q86VB7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD163Q86VB7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD163Q86VB7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD163Q86VB7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms