Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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