Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SMIM29Q86T20 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms