Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV89

SH2D5, SH2 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D5Q6ZV89 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH2D5Q6ZV89 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms