Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms