Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLX4IPQ5VYV7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms