Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM78BQ5VT40 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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