Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms