Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF212Q495C1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms