Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms