Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms