Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms