Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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