Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CA9Q16790 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CA9Q16790 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CA9Q16790 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CA9Q16790 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CA9Q16790 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CA9Q16790 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CA9Q16790 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CA9Q16790 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CA9Q16790 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CA9Q16790 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms