Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NTRK2Q16620 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NTRK2Q16620 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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