Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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