Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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SNAPC1Q16533 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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SNAPC1Q16533 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SNAPC1Q16533 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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