Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SIX1Q15475 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SIX1Q15475 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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