Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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IRF4Q15306 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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