Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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