Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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