Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms