Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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