Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN1Q14699 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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