Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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