Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RASGRF1Q13972 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RASGRF1Q13972 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms