Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7AQ13946 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDE7AQ13946 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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