Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms