Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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SHROOM2Q13796 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHROOM2Q13796 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
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