Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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