Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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