Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CUL4AQ13619 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CUL4AQ13619 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CUL4AQ13619 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CUL4AQ13619 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CUL4AQ13619 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CUL4AQ13619 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CUL4AQ13619 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CUL4AQ13619 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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