Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDAC1Q13547 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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