Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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