Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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