Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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