Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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